
Karin était la gardienne du repaire Sud d'Orochimaru. Chargée de maintenir l'ordre et de surveiller les prisonniers, elle assistait également Orochimaru dans certaines de ses expériences[1].
Après avoir vaincu Orochimaru, Sasuke vient au repaire Sud avec Suigetsu Hôzuki dans le but de l'intégrer à son équipe « Hebi » afin de profiter de ses capacités à ressentir le chakra.
D'abord réticente à rejoindre Sasuke, à cause de son poste de gardienne, sa position changera radicalement lorsque Suigetsu partira libérer les prisonniers et qu'elle restera seule avec Sasuke. Attirée par ce dernier, elle tentera de lui faire abandonner Suigetsu pour qu'ils partent tous les deux seuls. Au retour de ce dernier, elle prétextera vouloir « aller dans la même direction » afin de les suivre[1].
Après avoir recruté Jûgo, elle partira à la recherche d'informations concernant Itachi dans une région assez proche. Pendant ce temps, Sasuke combat Deidara. Retrouvant Sasuke dans un sale état, le reste de l'équipe se cachera dans une auberge. Karin sentira alors les ninjas de Konoha à leur poursuite.
Originaire de Kusa, Karin a participé à l'examen chūnin et y a rencontré Sasuke qui l'a défendue contre un ours dans la « Forêt de la Mort ». Ce fait n'est cependant connu qu'au cours de la seconde partie du manga[2].
Après la mort d'Itachi Uchiwa, but de l'équipe « Hebi », Karin reste dans le groupe renommé « Taka » allié à Akatsuki. Leur première mission est de retrouver Hachibi. Suite au combat contre le bijū, l'équipe sera affaiblie, malgré la capacité de Karin à soigner les gens lorsqu'on la mord. La jeune fille manqua même de se faire tuer par Amaterasu, déclenché par Sasuke. Suite à cette mission, l'équipe décida de se lancer à l'assaut de Konoha.
Mais, Madara apparaitra annonçant à Sasuke que Danzô, l'une des personnes ayant conduit Itachi à la traîtrise de son clan, se dirige vers le « Conseil des cinq kage », l'équipe Taka décide de s'y rendre. Grâce à ses talents sensoriels, Karin détectera rapidement Danzô. Durant le combat de Sasuke contre le 4ème Raikage, Karin sentira un chakra dans Sasuke; un chakra maléfique. Suite à ce combat, se retrouvant seule avec Sasuke, et ils réussirent à entrer dans la salle de réunion des kage, mais Sasuke ne fait pas le poids face aux kage présents dans la pièce et Karin se retrouvera aspirée dans une autre dimension avec Sasuke, par Madara afin de soigner le jeune Uchiwa.